يقوم الشخص ( فرد /شركة /مؤسسة /أي جهة أخرى ) الذي يرغب في تقديم طلب إفراغ أو توثيق لأي حالة تصرف عقاري إلى أي شخص آخر ( سواء كان المشتري فردًا، أو شركة، أو مؤسسة، أو أي شكل آخر ) بالدخول إلى خدمة ضريبة التصرف العقاري المتاحة على موقع الهيئة العامة للزكاة والدخل قبل بدء إجراءات الإفراغ الرسمية لدى وزارة العدل أو الهيئة العامة للمدن الاقتصادية الخاصة أو قبل أو أثناء عملية التوثيق بينه وبين الجهة المتعاقد معها، ويقوم بإدخال ( بيانات العقار، وبياناته الشخصية، ونوع العقار، وطبيعة التصرف العقاري ) -على سبيل المثال- ( بيع، هبة، تقسيم تركة... إلخ ) ، وفي حال إفادة البيانات المقدمة من الفرد باستثناء العقار من ضريبة التصرفات العقارية وفقاً لحالات الاستثناء المدرجة في نموذج الخدمة، فستقوم الهيئة بإشعار الشخص برقم مرجعي مرتبط بتلك العملية التي تفيد بعدم خضوع هذا العقار لضريبة التصرفات العقارية، حيث يستخدم هذا الرقم المرجعي في استكمال إجراءات الإفراغ لدى الجهة المختصة ( وزارة العدل أو الهيئة العامة للمدن الاقتصادية الخاصة )، وفي حال وجوب سداد الضريبة ستقوم الهيئة بإرسال فاتورة سداد بمبلغ الضريبة المستحقة على العقار لسدادها أولاً قبل استكمال إجراءات الإفراغ لدى الجهة المختصة ( وزارة العدل أو الهيئة العامة للمدن الاقتصادية الخاصة ) أما إذا كانت العملية تتعلق بتصرف عقاري آخر لا توثق كإفراغ لدى الجهات الرسمية فيقوم المستفيد باختيار خيار "عقود وتعاملات أخرى خاضعة لضريبة التصرفات العقارية" بعد إدخال معلومات الهوية ويقوم بعدها بتسجيل الجهة المتعاقد معها والرقم المرجعي للعملية أو رقم العقد ومن ثم اختيار الاستثناء إذا كانت مستثناة من الضريبة أو دفع الضريبة.
