تقوم الهيئة بإيداع أموال الزكاة بشكل كامل في حساب وكالة الضمان الاجتماعي التابعة لوزارة العمل والتنمية الاجتماعية لتصرف على مستحقيها من المستفيدين في الضمان الاجتماعي، علما بأن الهيئة لا تحصل على أي مبلغ من مبالغ الزكاة، فإنه وكما تمت الإشارة إليه، جميع مبالغ الزكاة يتم إيداعها في حساب الصمان الاجتماعي.
