تعرف الزكاة المستحقة على المنشأة بتعبئة الإقرار الزكوي لدى الهيئة، ثم يظهر للمنشأة الزكاة المستحقة بناءً على الإقرار المقدم، والزكاة المستحقة هي 2.5% من الوعاء الزكوي، ويتكون الوعاء الزكوي من إجمالي مصادر التمويل محسومًا منها الأصول الثابتة، وما في حكمها.

وتقوم الهيئة بحساب الوعاء الزكوي وفقًا للقاعدة الآتية:

الوعاء الزكوي + إ جمالي مصادر التمويل - الأصول الثابتة، وما في حكمها.​